Venta de cigarrillos


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Buenas tardes:
Es la primera vez que voy a llevar la documentacion a un Kiosco que vende cigarrillos.
es monotributista, su contador anterior le hacia facturar (según lo que me cuenta el cliente), solamente al final del dia una factura por el total de mercaderia vendida y otra factura por el importe de ganancia de cigarrillos.
ahora compró el controlador, pero no sé como hacerle facturar los cigarrillos, ya que en las facturas de compra figura lo que compro y al hacer el ticket, si factura todo el importe del cigarrillo quedaria fuera de categoria, y si no lo hace, el cruce con arba va a ser un problema.
Como hacen uds?, alguien puede ayudarme
gracias